seq1 = cn416, 630 bp
seq2 = Contig147.fa (>Contig147), 1086 bp
36-132 (191-286) 89% <-
133-191 (343-401) 93%
0 . : . : . : . : . :
36 AAAGCCATGCAATGCATCCCATGATACCAAAGATAAAATATCCAAAAATC
|||||||||||||||||||-||||||||||||| || |||||||||||||
191 AAAGCCATGCAATGCATCC ATGATACCAAAGACAATATATCCAAAAATC
50 . : . : . : . : . :
86 CATGACCGATCCTGATGCAATAACCAAGAGACCGTTTATCCCGGGAA
| || |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||<<<
240 TAAGATTGATCATCATGCAATAACCAAGAGACCCTTTATCCCGGGAACTA
100 . : . : . : . : . :
133 TGCCACAACGTAGTCCTTCTGTACATCCTGAACATTTCCATCAT
...<<<|||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
290 ...CACTGCCACAACGTAGTCCTTTTGTACATCCTGAACATTTCCATCAT
150 . : .
177 CATCAACGAA AAGTA
|||| |||||-||-||
387 CATCTACGAACAA TA