AS 36 39

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AF 5765593 U 1
BS 1 131 5765593

RD 5765593 131 0 6
gctagaaaaaaaaggactcccagtagaaatacgtacaataaagtaggttc
ctctagttaactgttacaaaataagtttcccattggtaatataatagatt
tataactgttatatccagagcaacctagggg

QA 1 131 1 131

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CO Contig2 139 1 1 U
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AF 5740343 U 1
BS 1 139 5740343

RD 5740343 139 0 4
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QA 4 139 1 139

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CO Contig3 118 1 1 U
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AF 5685889 U 1
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QA 44 118 1 118

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RT{
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CO Contig4 81 1 1 U
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AF 5695780 U 1
BS 1 81 5695780

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acattcatactggacagcagtgtagacttaa

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BQ
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AF 5659765 U 1
BS 1 86 5659765

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QA 1 86 1 86

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CO Contig6 83 1 1 U
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BQ
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AF 5772270 U 1
BS 1 83 5772270

RD 5772270 83 0 2
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QA 7 83 1 83

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5772270 matchElsewhereHighQual phrap 6 81 080215:162048
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BQ
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AF 5717803 U 1
BS 1 82 5717803

RD 5717803 82 0 1
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QA 15 82 1 82

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5717803 matchElsewhereHighQual phrap 29 82 080215:162048
}

CO Contig8 139 1 1 U
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AF 5671215 U 1
BS 1 139 5671215

RD 5671215 139 0 0
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QA 70 139 1 139

CO Contig9 81 1 1 U
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AF 5726177 U 1
BS 1 81 5726177

RD 5726177 81 0 2
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QA 1 81 1 81

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}

RT{
5726177 matchElsewhereHighQual phrap 1 77 080215:162048
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CO Contig10 83 1 1 U
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AF 5741972 U 1
BS 1 83 5741972

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QA 1 83 1 83

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5741972 matchElsewhereHighQual phrap 11 78 080215:162048
}

CO Contig11 177 1 1 U
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
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QA 1 177 1 177

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}

RT{
5695538 matchElsewhereHighQual phrap 1 167 080215:162048
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CO Contig12 121 1 1 U
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
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AF 5732765 U 1
BS 1 121 5732765

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QA 2 121 1 121

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5732765 matchElsewhereHighQual phrap 81 110 080215:162048
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5732765 matchElsewhereHighQual phrap 2 55 080215:162048
}

CO Contig13 119 1 1 U
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BQ
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AF 5685756 U 1
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QA 3 119 1 119

RT{
5685756 matchElsewhereHighQual phrap 7 86 080215:162048
}

CO Contig14 178 1 1 U
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5693041 U 1
BS 1 178 5693041

RD 5693041 178 0 1
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
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QA 1 178 1 178

RT{
5693041 matchElsewhereHighQual phrap 1 168 080215:162048
}

CO Contig15 115 1 1 U
ttgaaggatggtagccatcctactctttttctataagttatgttccgcca
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BQ
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5651991 U 1
BS 1 115 5651991

RD 5651991 115 0 2
ttgaaggatggtagccatcctactctttttctataagttatgttccgcca
ggaagagcagccgccgttagatagggactcacaacccttcaaaatcgccc
taagacttctcaacc

QA 1 115 1 115

RT{
5651991 matchElsewhereHighQual phrap 47 115 080215:162048
}

RT{
5651991 matchElsewhereHighQual phrap 1 46 080215:162048
}

CO Contig16 83 1 1 U
cacacacaaacacacacacacacccacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

BQ
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5756120 U 1
BS 1 83 5756120

RD 5756120 83 0 2
cacacacaaacacacacacacacccacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

QA 1 83 1 83

RT{
5756120 matchElsewhereHighQual phrap 25 83 080215:162048
}

RT{
5756120 matchElsewhereHighQual phrap 9 23 080215:162048
}

CO Contig17 120 1 1 U
ttcaattttaatattattattattattattattattattattattattat
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BQ
 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5766191 U 1
BS 1 120 5766191

RD 5766191 120 0 1
ttcaattttaatattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattattattattattattattattattactactacta
ctactactactactactgtc

QA 8 120 1 120

RT{
5766191 matchElsewhereHighQual phrap 12 91 080215:162048
}

CO Contig18 81 1 1 U
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
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BQ
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0

AF 5701563 U 1
BS 1 81 5701563

RD 5701563 81 0 1
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
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QA 1 81 1 81

RT{
5701563 matchElsewhereHighQual phrap 1 76 080215:162048
}

CO Contig19 85 1 1 U
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BQ
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5710086 U 1
BS 1 85 5710086

RD 5710086 85 0 1
gtgtgtgtgcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
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QA 1 85 1 85

RT{
5710086 matchElsewhereHighQual phrap 11 74 080215:162048
}

CO Contig20 175 1 1 U
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BQ
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5692289 U 1
BS 1 175 5692289

RD 5692289 175 0 3
ttattttatttattttatttattttatttattttatttattttatttatt
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QA 1 175 1 175

RT{
5692289 matchElsewhereHighQual phrap 159 175 080215:162048
}

RT{
5692289 matchElsewhereHighQual phrap 137 157 080215:162048
}

RT{
5692289 matchElsewhereHighQual phrap 1 135 080215:162048
}

CO Contig21 122 1 1 U
agtgttattactattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattatttccactaacaaaatatatatataatataatt
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BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5731835 U 1
BS 1 122 5731835

RD 5731835 122 0 0
agtgttattactattattattattattattattattattattattattat
tattattattattattatttccactaacaaaatatatatataatataatt
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QA 77 122 1 122

CO Contig22 79 1 1 U
cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5734795 U 1
BS 1 79 5734795

RD 5734795 79 0 1
cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

QA 1 79 1 79

RT{
5734795 matchElsewhereHighQual phrap 1 79 080215:162048
}

CO Contig23 72 1 1 U
atatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
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BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5769497 U 1
BS 1 72 5769497

RD 5769497 72 0 1
atatatatatgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

QA 10 72 1 72

RT{
5769497 matchElsewhereHighQual phrap 10 72 080215:162048
}

CO Contig24 71 1 1 U
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtagt

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5685312 U 1
BS 1 71 5685312

RD 5685312 71 0 1
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtagt

QA 1 71 1 71

RT{
5685312 matchElsewhereHighQual phrap 1 68 080215:162048
}

CO Contig25 79 1 1 U
catacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5654419 U 1
BS 1 79 5654419

RD 5654419 79 0 1
catacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

QA 3 79 1 79

RT{
5654419 matchElsewhereHighQual phrap 31 79 080215:162048
}

CO Contig26 85 1 1 U
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BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5722605 U 1
BS 1 85 5722605

RD 5722605 85 0 1
cgaagacccggtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg

QA 11 85 1 85

RT{
5722605 matchElsewhereHighQual phrap 10 85 080215:162048
}

CO Contig27 83 1 1 U
attnatattaatacanaacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5667144 U 1
BS 1 83 5667144

RD 5667144 83 0 2
attnatattaatacanaacacacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacacacac

QA 12 83 1 83

RT{
5667144 matchElsewhereHighQual phrap 18 83 080215:162048
}

RT{
5667144 matchElsewhereHighQual phrap 17 31 080215:162048
}

CO Contig28 103 1 1 U
atcatttaggattgctatattttggattttggattgggaaatgcctggct
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tca

BQ
 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15

AF 5754151 U 1
BS 1 103 5754151

RD 5754151 103 0 0
atcatttaggattgctatattttggattttggattgggaaatgcctggct
agacaaccgttctggaaattgaaatcatgcagatgtaaacaaaaatggga
tca

QA 3 103 1 103

CO Contig29 79 1 1 U
natacacacacatacatacatacacaatctcacacacacacacacacaca
cacacacacacacacacacacacacacac

BQ
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5764329 U 1
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cacacacacacacacacacacacacacac

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tgttgttattattattattattattattattattattattattattatta
ttattattatta

BQ
 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5725479 U 1
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tgttgttattattattattattattattattattattattattattatta
ttattattatta

QA 33 112 1 112

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gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5762369 U 1
BS 1 78 5762369

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gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt

QA 1 78 1 78

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5762369 matchElsewhereHighQual phrap 1 78 080215:162048
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CO Contig32 82 1 1 U
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acacacacacacacacacacacacgacgacnc

BQ
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15
 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 0 0

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acacacacacacacacacacacacgacgacnc

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gtgtgtgtgtgt

BQ
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 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15 15

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gtgtgtgtgtgt

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BQ
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 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15

AF 5704073 U 2
AF 5762101 U 1
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ATCATCGCta*tcAAGCCta*caGTTTGAAGACATTTCTAATTTAAta

QA 4 98 1 98

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TAAATTta

BQ
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 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 25 25 25 15 15

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AF 5729853 U 1
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TAAATTta

QA 1 108 1 108

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CTATGTGCTTCATAGTCTAAAAAGATGATCTGTTAATGAAGGGAAAAAAC
TAAATTta

QA 1 108 1 108

CO Contig36 111 2 63 U
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BQ
 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 15 15 15 15 15 15 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25
 25 25 25 15 15 15 15 15 15 15 15

AF 5648323 U 1
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TGCtccaatcg

QA 1 111 1 111

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taTAAAGTCGATGGGGAGGAAGATAGGGGAGCTAAAGCCATAGGGAAACC
ACGTAGTTCTGCGTCAAGCGTTgc*ttcCGAGGTGCTCTCCGCTTTTCCA
TGCtcatcg

QA 1 109 1 105

RT{
5703145 compression phrap 74 76 080215:162048
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